是，16岁未成年签订的电动车租赁协议可能生效。依据《民法典》相关规定，16周岁以上不满18周岁的未成年人，以自己的劳动收入为主要生活来源的，视为完全民事行为能力人，可独立签订有效协议；若其签订协议无其他效力瑕疵，协议同样有效。反之，若协议存在如违反法律强制性规定等效力瑕疵，则协议无效。不及时确认协议效力，若发生纠纷可能导致协议无法履行，甚至引发诉讼。
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常见的处理方式为确认协议效力和履行协议。应先确认16岁未成年是否以自己的劳动收入为主要生活来源，再确认协议内容是否合法合规，最后确定是否继续履行或解除协议。若未成年无独立生活来源，建议由其法定代理人代为确认协议效力；若协议内容违法，应及时解除以避免法律风险。
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分情况处理。未满8岁，协议无效，需法定代理人追认；8-16岁，若其有独立生活来源，则协议有效；反之，协议需法定代理人追认；16岁以上，若协议无瑕疵，则协议有效，继续履行。若存在违法情形，立即解除以避免法律风险。